Table 6 Gene prioritization results of CLIP-GENE at GSE53398 (Barx2 KO) data
| Â | Context: | Context: | Context: | Context: |
|---|---|---|---|---|
Reported gene | Myoblast progeny* | Muscle maintenance | Chondrogensis | Morphogenesis |
Gdnf | - | - | - | - |
Id2 | - | - | - | 271 |
Mmp9 | 9 | 29 | 8 | 129 |
Smo | - | - | - | - |
Sox2 | - | - | - | 9 |
Wisp1 | - | - | - | - |
Wisp2 | - | - | - | - |
Ahr | - | - | - | - |
Axin2 | - | - | - | - |
Cacna2d3 | - | - | - | - |
Ccnd1 | - | - | - | - |
Ccnd2 | - | - | - | - |
Ctgf | - | - | - | - |
Dlk1 | - | - | - | 319 |
Fgf7 | - | - | - | - |
Fst | - | - | - | 307 |
Fzd7 | - | - | - | - |
Gdf5 | - | - | - | - |
Igf2 | - | - | - | - |
Klf5 | - | - | - | 96 |
Pdgfra | 4 | 8 | 4 | 573 |
Pitx2 | - | - | - | 4 |
Tgfb3 | - | - | - | 780 |
Wnt5a | - | - | - | - |
Fzd4 | - | - | - | 193 |
Fzd6 | - | - | - | - |
Sfrp1 | - | - | - | 188 |
Tle2 | - | - | - | - |
Dvl1 | - | - | - | 168 |
Nkd1 | - | - | - | - |
Porcn | - | - | - | 367 |
Wif1 | - | - | - | 74 |
Wnt4 | - | - | - | - |
Axin1 | - | - | - | - |
Fstl1 | - | - | - | - |
Fstl3 | - | - | - | - |
Hey1 | - | - | - | 122 |
Hey2 | - | - | - | - |
Heyl | - | - | - | - |
Hes1 | - | - | - | 34 |
Hes6 | - | - | - | - |
Snai1 | - | - | - | 295 |
Snai2 | - | - | - | 399 |
Snai3 | - | - | - | 526 |
Fos | - | - | - | - |
Nrap | - | - | - | - |
Id1 | - | - | - | 205 |
reproduced true positives/ | Â | |||
predicted candidates | 2/11 | 2/42 | 2/12 | 20/923 |