From: The evolutionary scope and neurological disease linkage of yeast-prion-like proteins in humans
Species short name | Species binomial name (some clade names are listed in this column for clarity) | TOTALS OF YEAST-PRION-LIKE PROTEINSa | CONSERVATION OF PRION-LIKE PROTEINS FROM YEASTb | CONSERVATION OF YEAST-PRION-LIKE PROTEINS FROM HUMANb | ||||||
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(1) TOTAL # of N/Q-rich proteins (NQPs) | (2) TOTAL # of prion predictions (yeast background) | (3) TOTAL # of prion predictions (organism’s background) | (4) # of YEAST proteins conserved as orthologs (total 5879) | (5) | (6) | (7) # of HUMAN proteins conserved as orthologs (total 101,933) | (8) | (9) | ||
YEAST | Saccharomyces cerevisiae | 285 ( 4 . 9  %) | 186 (3 . 2  %) | 186 ( 3 . 2  %) | -- | -- | -- | 4076 (4.0 %) | 9 (0.7 %) | 4 |
TRICHOPLAX | Trichoplax adhaerens | 220 (1.9 %) | 308 (2.7 %) | 276 ( 2 . 4  %) | 2223 (38 %) | 3 (1.0 %) | 5 | 9992 (9.8 %) | 24 (1.9 %) | 24 |
SPONGE | Amphimedon queenslandica | 192 (1.4Â %) | 217 (1.6Â %) | 166 (1.2Â %) | 2230 (38Â %) | 1 (0.4Â %) | 5 | 9565 (9.4Â %) | 16 (1.3Â %) | 27 |
 | Protostomia |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
DROSOPHILA | Drosophila melanogaster | 3085 (11  %) | 2064 ( 7 . 7  %) | 1653 ( 5 . 9  %) | 2176 (37 %) | 26 (9.1 %) | 14 | 10138 (10 %) | 117 (9.2 %) | 72 |
DAPHNIA | Daphnia pulex | 461 (1.5Â %) | 509 (1.7Â %) | 307 (1.0Â %) | 2209 (38Â %) | 5 (1.8Â %) | 4 | 10609 (10Â %) | 44 (3.5Â %) | 30 |
C_ELEGANS | Caenorhabditis elegans | 827 (2.6 %) | 1112 ( 3 . 5  %) | 732 (2.3 %) | 2044 (35 %) | 11 (3.9 %) | 14 | 8670 (8.5 %) | 41 (3.2 %) | 27 |
OYSTER | Crassostrea gigas | 1059 (2.3Â %) | 1414 (3.1Â %) | 988 (2.1Â %) | 2333 (40Â %) | 7 (2.5Â %) | 14 | 12934 (13Â %) | 126 (9.9Â %) | 89 |
APLYSIA | Aplysia californica | 1342 ( 4 . 9  %) | 954 ( 3 . 5  %) | 645 ( 2 . 4  %) | 2310 (39 %) | 14 (4.9 %) | 12 | 11017 (11 %) | 35 (2.8 %) | 30 |
LEECH | Helobdella robusta | 3593 ( 15  %) | 2053 ( 8 . 8  %) | 1605 ( 6 . 7  %) | 2159 (37 %) | 13 (4.6 %) | 7 | 10834 (11 %) | 65 (5.1 %) | 30 |
 | Deuterostomia |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
SEA_URCHIN | Strongylocentrotus purpuratus | 1007 (2.8Â %) | 909 (2.5Â %) | 581 (1.6Â %) | 2355 (40Â %) | 12 (4.2Â %) | 13 | 13596 (13Â %) | 117 (9.2Â %) | 59 |
ZEBRAFISH | Danio rerio | 671 (1.6Â %) | 805 (1.9Â %) | 617 (1.5Â %) | 2389 (41Â %) | 5 (1.8Â %) | 6 | 20283 (20Â %) | 213 (17Â %) | 143 |
FUGU | Takifugu rubripes | 940 (2.0Â %) | 912 (1.9Â %) | 719 (1.5Â %) | 2314 (39Â %) | 4 (1.4Â %) | 4 | 20340 (20Â %) | 205 (17Â %) | 129 |
CHICKEN | Gallus gallus | 276 (1.7Â %) | 227 (1.4Â %) | 178 (1.1Â %) | 2176 (37Â %) | 8 (2.8Â %) | 3 | 18441 (18Â %) | 247 (19Â %) | 144 |
ANOLIS | Anolis caroliniensis | 798 (2.5Â %) | 624 (1.9Â %) | 468 (1.5Â %) | 2311 (39Â %) | 5 (1.8Â %) | 3 | 22209 (22Â %) | 320 (25Â %) | 197 |
MOUSE | Mus musculus | 1001 (1.8Â %) | 675 (1.2Â %) | 497 (0.9Â %) | 2397 (41Â %) | 6 (2Â %) | 5 | 30987 (30Â %) | 514 (41Â %) | 314 |
HUMAN | Homo sapiens | 1269 (1.2Â %) | 1012 (1.0Â %) | 766 (0.7Â %) | 2399 (41Â %) | 5 (1.8Â %) | 3 | -- | -- | -- |
OPOSSUM | Monodelphis domestica | 382 (1.7Â %) | 298 (1.4Â %) | 225 (1.0Â %) | 2329 (40Â %) | 7 (2.5Â %) | 3 | 22205 (22Â %) | 290 (23Â %) | 197 |
XENOPUS | Xenopus laevis | 348 (1.5Â %) | 376 (1.7Â %) | 317 (1.4Â %) | 2299 (39Â %) | 9 (3.2Â %) | 4 | 19444 (19Â %) | 226 (18Â %) | 131 |
LATIMERIA | Latimeria calumnae | 407 (1.7Â %) | 415 (1.8Â %) | 330 (1.4Â %) | 2276 (39Â %) | 7 (2.5Â %) | 2 | 19756 (19Â %) | 273 (22Â %) | 145 |
CIONA | Ciona intestinalis | 283 (1.8 %) | 491 (3.2 %) | 389 ( 2 . 5  %) | 2213 (38 %) | 4 (1.4 %) | 5 | 11547 (11 %) | 72 (5.7 %) | 67 |
HYDRA | Hydra vulgaris | 712 (3.2Â %) | 489 (2.2Â %) | 431 (1.9Â %) | 2235 (38Â %) | 14 (4.9Â %) | 11 | 10605 (10Â %) | 41 (3.2Â %) | 36 |
CHOANAFLAGELLATE | Monosiga brevicollis | 273 (3.0Â %) | 134 (1.5Â %) | 85 (0.9Â %) | 2015 (34Â %) | 4 (1.4Â %) | 5 | 6632 (6.5Â %) | 12 (0.9Â %) | 7 |
DICTYOSTELIUM | Dictyostelium discoideum | 5345 ( 40  %) | 3067 ( 23  %) | 2567 ( 19  %) | 2199 (37 %) | 65 (23 %) | 34 | 5839 (5.8 %) | 37 (2.9 %) | 31 |
PLASMODIUM | Plasmodium falciparum | 2649 ( 50  %) | 1248 ( 23  %) | 1143 ( 22  %) | 1351 (23 %) | 23 (8.1 %) | 20 | 3207 (3.1 %) | 30 (2.4 %) | 25 |
CHONDRUS | Chondrus crispus | 49 (0.5Â %) | 93 (0.9Â %) | 62 (0.6Â %) | 1716 (29Â %) | 6 (2Â %) | 7 | 3790 (3.7Â %) | 2 (0.2Â %) | 5 |
 | Plants |  |  |  |  |  |  |  |  |  |
PHYSCOMITRELLA | Physcomitrella patens | 169 (0.5Â %) | 323 (0.9Â %) | 246 (0.7Â %) | 2279 (39Â %) | 5 (1.8Â %) | 3 | 6450 (6.3Â %) | 6 (0.5Â %) | 5 |
SELAGINELLA | Selaginella moellendorffii | 285 (0.8Â %) | 243 (0.7Â %) | 164 (0.5Â %) | 2247 (38Â %) | 1 (0.4Â %) | 1 | 6370 (6.3Â %) | 10 (0.8Â %) | 4 |
AMBORELLA | Amborella trichopoda | 171 (0.8Â %) | 251 (1.2Â %) | 164 (0.8Â %) | 2288 (39Â %) | 4 (1.4Â %) | 4 | 6079 (6.0Â %) | 13 (1.0Â %) | 4 |
BANANA | Musa acuminata | 421 (1.0Â %) | 403 (1.0Â %) | 295 (0.7Â %) | 2281 (39Â %) | 7 (2.5Â %) | 4 | 6328 (6.2Â %) | 5 (0.4Â %) | 4 |
RICE | Oryza sativa | 1118 (1.6Â %) | 928 (1.4Â %) | 540 (0.8Â %) | 2264 (39Â %) | 6 (2Â %) | 8 | 6144 (6.0Â %) | 9 (0.7Â %) | 8 |
ARABIDOPSIS | Arabidopsis thaliana | 342 (1.0Â %) | 570 (1.7Â %) | 412 (1.2Â %) | 2300 (39Â %) | 7 (2.5Â %) | 7 | 6235 (6.2Â %) | 11 (0.9Â %) | 9 |
CHLAMYDOMONAS | Chlamydomonas reinhardtii | 441 (3.0Â %) | 180 (1.2Â %) | 142 (1.0Â %) | 1914 (33Â %) | 1 (0.4Â %) | 0 | 5235 (5.2Â %) | 7 (0.6Â %) | 2 |
TRYPANOSOMA | Trypanosoma cruzi | 359 (1.8Â %) | 225 (1.1Â %) | 172 (0.9Â %) | 1539 (26Â %) | 8 (2.8Â %) | 3 | 4032 (3.9Â %) | 9 (0.7Â %) | 13 |
GUILLARDIA | Guillardia theta | 318 (1.3Â %) | 238 (1.0Â %) | 163 (0.7Â %) | 2115 (36Â %) | 4 (1.4Â %) | 4 | 6409 (6.3Â %) | 6 (0.5Â %) | 5 |