Table 4 Deviation in transcription (log obs/exp) in the individual genes of the 37 most disorderly libraries.
A. The 15 most disorderly libraries identified in the first set of 60 libraries. | ||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Â | Â | log obs/exp | ||||||||||||||
| Â | gene | PSMA1 | PSMA2 | PSMA3 | PSMA4 | PSMA5 | PSMA6 | PSMA7 | PSMB1 | PSMB2 | PSMB3 | PSMB4 | PSMB5 | PSMB6 | PSMB7 | deviation index |
GSM | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
671 | Â | -0,954 | -0,288 | -0,552 | 0,172 | -0,872 | -0,364 | -0,169 | -0,412 | -0,309 | 0,625 | -0,938 | -0,727 | -0,513 | -0,414 | 0,431 |
686 | Â | -0,015 | 0,048 | -0,216 | -1,115 | -0,137 | -0,115 | 0,013 | -0,107 | -0,398 | 0,025 | 0,731 | 0,309 | -0,222 | -0,202 | 0,399 |
672 | Â | -0,497 | -0,133 | 0,080 | -0,041 | -0,018 | -0,075 | -0,059 | -0,147 | -0,279 | 0,489 | -0,783 | -0,571 | -0,154 | -0,481 | 0,317 |
687 | Â | -0,171 | 0,193 | -0,071 | -0,669 | -0,390 | 0,474 | -0,688 | 0,401 | -0,430 | -0,977 | -0,457 | -0,245 | -0,254 | -0,234 | 0,409 |
699 | Â | -0,485 | -0,297 | -0,084 | -0,682 | 0,074 | -0,092 | 0,414 | -0,487 | 0,160 | -0,989 | 0,609 | 0,043 | 0,257 | 0,009 | 0,438 |
745 | Â | -0,299 | -0,111 | -0,199 | 0,048 | -0,519 | 0,410 | -0,038 | -0,426 | -0,558 | -0,406 | -0,585 | -0,373 | 0,220 | 0,115 | 0,311 |
786 | Â | 0,032 | -0,132 | -0,044 | -0,040 | -0,364 | 0,005 | -0,661 | -0,271 | -0,102 | -0,348 | -0,430 | 0,480 | -0,102 | 0,474 | 0,315 |
574 | Â | -0,171 | 0,052 | -0,071 | 0,309 | -0,691 | 0,005 | -0,143 | -0,377 | -0,731 | -0,074 | -0,059 | -0,245 | -0,129 | 0,323 | 0,305 |
760 | Â | 0,323 | -0,104 | -0,317 | -0,012 | -0,335 | 0,261 | 0,067 | 0,301 | -0,198 | -0,745 | 0,075 | -0,491 | 0,024 | -0,275 | 0,312 |
736 | Â | 0,459 | 0,135 | 0,048 | -0,006 | -0,573 | -0,630 | 0,130 | -0,180 | 0,087 | -0,460 | 0,315 | 0,174 | 0,233 | -0,074 | 0,329 |
1497 | Â | 0,275 | 0,111 | -0,102 | -0,399 | 0,277 | -0,178 | -0,719 | -0,204 | 0,493 | -0,054 | -0,488 | 0,422 | 0,016 | -0,010 | 0,347 |
762 | Â | -0,836 | 0,051 | 0,343 | 0,289 | 0,090 | 0,143 | -0,751 | -0,140 | -0,016 | 0,001 | -0,821 | -0,007 | -0,095 | 0,065 | 0,392 |
765 | Â | 0,053 | -0,361 | -0,148 | -0,445 | -0,166 | -0,302 | 0,349 | 0,102 | 0,396 | -0,054 | -0,534 | -0,322 | 0,234 | -0,010 | 0,291 |
740 | Â | 0,000 | 0,158 | 0,401 | -0,118 | 0,337 | 0,150 | -0,915 | -0,157 | -0,657 | -0,125 | -0,684 | -0,171 | 0,246 | -0,013 | 0,395 |
739 | Â | 0,198 | -0,025 | 0,298 | 0,126 | 0,346 | -0,130 | -0,796 | -0,106 | -0,061 | -0,044 | -0,565 | 0,549 | 0,115 | -0,041 | 0,347 |
mean | Â | -0,139 | -0,047 | -0,042 | -0,172 | -0,196 | -0,029 | -0,264 | -0,147 | -0,173 | -0,209 | -0,308 | -0,078 | -0,008 | -0,051 | Â |
standard deviation | Â | 0,413 | 0,175 | 0,252 | 0,406 | 0,380 | 0,291 | 0,446 | 0,254 | 0,361 | 0,462 | 0,522 | 0,400 | 0,229 | 0,252 | Â |
B. The 22 most disorderly libraries identified in the second set of 80 libraries. | ||||||||||||||||
| Â | gene | PSMA1 | PSMA2 | PSMA3 | PSMA4 | PSMA5 | PSMA6 | PSMA7 | PSMB1 | PSMB2 | PSMB3 | PSMB4 | PSMB5 | PSMB6 | PSMB7 | Â |
GSM | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
14761 | Â | -0,956 | 0,218 | -0,153 | 0,086 | -0,353 | 0,056 | -1,116 | -0,775 | -0,084 | -0,646 | -0,525 | -0,028 | -0,702 | 0,470 | 0,475 |
14746 | Â | 0,218 | -0,430 | -0,632 | -0,519 | -0,833 | 0,025 | 0,535 | 0,369 | -0,086 | -0,143 | 0,251 | -0,127 | -0,403 | -0,512 | 0,409 |
14799 | Â | 0,364 | 0,146 | -0,155 | -0,263 | -0,152 | -0,016 | -0,299 | -0,521 | 0,023 | -0,528 | -0,095 | 0,568 | 0,188 | 0,052 | 0,310 |
14775 | Â | -0,059 | -0,377 | -0,335 | -0,824 | -0,536 | -1,140 | 0,610 | -0,957 | 0,541 | -0,449 | -0,531 | -0,131 | 0,069 | 0,292 | 0,530 |
7800 | Â | 0,418 | 0,049 | 0,091 | -0,398 | 0,066 | -0,061 | 0,582 | -0,230 | -0,510 | -0,926 | 0,548 | -0,307 | -0,158 | -0,568 | 0,435 |
14806 | Â | 0,683 | -0,263 | -0,222 | -0,710 | 0,054 | -0,249 | 0,195 | 0,302 | -0,220 | -0,159 | 0,184 | -0,319 | 0,007 | -0,454 | 0,351 |
14807 | Â | 0,396 | -0,164 | 0,002 | -0,390 | -0,324 | -0,150 | 0,275 | 0,322 | 0,055 | -0,714 | 0,318 | 0,002 | -0,003 | -0,179 | 0,312 |
2385 | Â | 0,131 | -0,487 | -0,446 | 0,145 | 0,131 | -0,137 | 0,559 | 0,046 | 0,158 | -0,258 | -0,642 | -0,242 | -0,092 | -0,134 | 0,316 |
14781 | Â | -0,536 | -0,252 | -0,511 | -0,699 | -0,110 | -0,317 | -0,220 | -0,092 | -0,112 | 0,171 | 0,196 | 0,596 | 0,282 | 0,131 | 0,356 |
14766 | Â | -0,314 | 0,213 | -0,386 | -0,222 | -0,043 | -0,030 | -1,174 | -0,531 | 0,159 | 0,088 | -0,582 | -0,483 | 0,085 | 0,263 | 0,398 |
14782 | Â | -0,819 | -0,535 | -0,016 | -0,505 | -0,092 | -0,044 | -0,378 | 0,185 | -0,191 | 0,359 | 0,311 | 0,255 | -0,140 | -0,006 | 0,346 |
14740 | Â | 0,160 | 0,098 | 0,088 | -0,401 | 0,188 | 0,128 | -1,001 | 0,143 | -0,115 | -1,230 | 0,404 | -0,611 | 0,298 | -0,145 | 0,493 |
14783 | Â | -0,553 | 0,208 | 0,074 | 0,129 | -0,428 | -0,129 | -0,015 | -0,372 | 0,075 | -0,642 | -0,423 | -0,324 | -0,476 | 0,400 | 0,324 |
8867 | Â | 0,236 | 0,140 | 0,085 | 0,295 | 0,583 | -0,021 | 0,076 | -0,537 | -0,038 | -0,233 | 0,190 | -0,313 | -0,163 | -0,574 | 0,322 |
14745 | Â | -0,481 | 0,105 | -0,155 | -0,643 | -0,356 | -0,057 | -0,641 | 0,399 | -0,153 | 0,033 | 0,552 | -0,252 | 0,141 | -0,387 | 0,360 |
14792 | Â | -0,241 | 0,140 | -0,216 | 0,250 | 0,428 | -0,118 | -0,226 | -0,139 | -0,515 | -0,455 | -0,412 | -0,313 | -0,465 | 0,311 | 0,308 |
14795 | Â | -0,467 | 0,169 | -0,141 | -0,153 | 0,135 | -0,044 | -0,628 | 0,467 | 0,258 | -0,255 | -0,337 | 0,239 | -0,390 | -0,198 | 0,315 |
14786 | Â | -0,305 | 0,307 | -0,280 | 0,077 | 0,519 | -0,044 | -0,766 | 0,140 | -0,102 | -0,217 | -0,476 | -0,076 | -0,227 | -0,035 | 0,320 |
14768 | Â | -0,309 | -0,627 | 0,016 | -0,171 | 0,293 | 0,290 | -0,771 | 0,093 | -0,584 | 0,079 | -0,480 | -0,382 | -0,232 | 0,159 | 0,351 |
14780 | Â | -0,460 | 0,000 | -0,135 | 0,280 | -0,335 | -0,095 | 0,525 | -0,279 | -0,434 | -0,151 | -0,330 | -0,231 | 0,015 | -0,015 | 0,272 |
14757 | Â | -0,217 | -0,234 | 0,586 | 0,097 | -0,393 | -0,095 | 0,099 | 0,265 | -0,191 | -0,607 | -0,388 | -0,289 | 0,212 | 0,052 | 0,316 |
1734 | Â | -0,425 | -0,178 | 0,026 | 0,316 | -0,175 | -0,080 | 0,114 | 0,006 | -0,030 | -0,036 | -0,471 | -0,196 | -0,280 | 0,192 | 0,221 |
mean | Â | -0,161 | -0,080 | -0,128 | -0,192 | -0,079 | -0,106 | -0,167 | -0,077 | -0,095 | -0,314 | -0,124 | -0,135 | -0,111 | -0,040 | Â |
standard deviation | Â | 0,432 | 0,284 | 0,260 | 0,367 | 0,358 | 0,261 | 0,580 | 0,402 | 0,265 | 0,382 | 0,409 | 0,308 | 0,269 | 0,314 | Â |