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Table 3 Expression of the proteasome genes in the selected SAGE libraries.

From: Hereditary profiles of disorderly transcription?

                   

deviation index

GEO

total tags

tissue

PSMA1

PSMA2

PSMA3

PSMA4

PSMA5

PSMA6

PSMA7

PSMB1

PSMB2

PSMB3

PSMB4

PSMB5

PSMB6

PSMB7

Sum

 

log ratio

z-score

30 normal libraries

676

94876

brain

6

4

0

0

6

3

6

5

7

1

3

1

4

8

54

 

0,377

1,698

677

37642

breast

4

6

2

4

3

14

7

12

1

7

4

0

3

6

73

 

0,224

1,087

780

63227

breast

2

4

2

4

4

4

9

4

2

6

1

1

2

10

55

 

0,221

1,083

781

58444

breast

1

10

0

0

0

3

8

1

4

4

1

2

6

5

45

 

0,326

1,556

685

66483

prostate

8

15

2

8

6

11

20

19

4

28

29

9

9

21

189

 

0,274

2,856

688

28950

breast

1

3

3

8

1

9

5

4

2

7

1

0

4

6

54

 

0,232

1,037

691

7165

breast

1

5

1

3

1

7

1

1

0

4

1

0

1

2

28

 

0,235

0,911

692

12142

breast

1

7

0

2

0

2

0

2

1

3

0

0

2

4

24

 

0,181

1,063

695

58826

brain

2

2

1

1

5

5

1

4

0

2

0

1

5

7

36

 

0,270

1,244

708

41857

kidney

2

2

3

4

1

6

7

1

0

4

2

1

4

5

42

 

0,280

1,156

713

48548

brain

1

0

0

1

1

5

0

4

1

4

0

2

5

5

29

 

0,243

1,017

574

102359

retina

4

13

2

19

0

17

7

5

0

16

5

2

8

36

134

 

0,305

1,784

719

48552

ovary

6

14

0

10

3

7

4

13

9

9

8

2

7

8

100

 

0,230

1,453

572

59661

retina

3

1

1

5

2

6

6

6

2

8

2

0

9

16

67

 

0,256

1,081

573

105312

retina

2

9

4

14

3

8

5

5

3

14

5

1

8

29

110

 

0,243

1,481

760

49281

ovary

11

8

1

8

2

27

10

21

3

3

6

0

10

8

118

 

0,310

1,849

728

50179

colon

5

1

2

1

4

1

6

11

2

0

1

1

9

2

46

 

0,468

1,918

729

49593

colon

5

0

1

2

1

4

5

7

3

7

1

0

6

6

48

 

0,265

1,130

761

51280

brain

4

1

2

4

0

5

4

1

2

1

0

1

6

6

37

 

0,337

1,204

1499

84357

heart

6

16

4

7

7

28

11

14

1

17

1

5

14

27

158

 

0,302

1,005

819

53853

muscle

2

6

0

3

1

9

10

2

3

2

5

3

6

7

59

 

0,279

1,348

824

53875

muscle

5

3

2

2

3

13

9

3

2

4

0

6

10

9

71

 

0,291

1,492

785

66861

liver

2

14

2

9

12

14

2

14

3

15

2

4

7

27

127

 

0,273

1,504

762

89143

lung

1

15

6

21

7

27

2

10

6

22

1

4

10

23

155

 

0,369

1,597

786

77986

brain

3

4

0

4

1

8

1

3

2

4

0

5

4

24

63

 

0,284

1,744

763

63208

brain

4

0

0

5

0

2

4

5

3

7

4

0

5

5

44

 

0,292

1,284

3242

37292

skin

0

5

0

6

1

5

8

3

1

4

0

0

3

4

40

 

0,210

1,289

2386

55422

spinal cord

2

7

3

3

1

6

3

8

2

9

2

2

5

9

62

 

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738

54096

peritoneum

2

1

0

0

1

2

5

4

3

4

1

0

4

4

31

 

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739

59553

prostate

6

7

3

8

7

8

0

6

3

11

0

8

9

10

86

 

0,328

1,611

30 tumor libraries

2451

38634

brain

0

3

0

3

2

3

3

4

1

4

2

3

5

7

40

 

0,199

0,872

2443

80265

brain

2

15

0

10

2

15

8

10

7

13

1

3

8

12

106

 

0,229

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2578

69513

brain

0

10

3

0

6

12

1

9

6

9

4

3

5

11

79

 

0,313

1,246

699

28159

brain

1

3

1

0

3

7

13

2

4

1

12

2

10

9

68

 

0,441

2,451

698

77004

brain

4

5

1

3

2

10

7

5

1

3

6

4

11

2

64

 

0,323

1,504

697

52479

brain

0

4

2

2

2

4

6

4

0

4

1

0

0

5

34

 

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672

67386

breast

2

9

3

9

5

15

9

9

3

62

1

1

8

6

142

 

0,327

3,481

687

41378

breast

2

9

1

1

1

25

1

15

0

1

0

0

3

5

64

 

0,375

2,245

670

40223

breast

3

3

0

14

1

12

6

4

4

65

1

1

2

8

124

 

0,375

4,170

755

57686

colon

5

3

2

2

2

4

3

4

0

3

4

0

2

3

37

 

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756

49064

colon

7

6

1

1

5

5

2

7

5

9

0

0

2

6

56

 

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1,423

792

34537

brain

2

4

2

3

2

9

0

15

2

5

0

0

3

5

52

 

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1497

46928

brain

6

8

0

2

5

6

0

4

9

9

0

5

6

9

69

 

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1,651

793

56871

brain

9

9

3

8

3

13

2

17

0

7

2

0

4

13

90

 

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1,471

696

70087

brain

3

11

0

3

4

5

11

13

11

10

6

3

15

13

108

 

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1,561

765

61886

brain

4

3

0

2

2

5

13

9

8

10

0

0

11

10

77

 

0,291

1,714

745

60069

brain

2

6

0

7

1

29

6

3

0

5

0

0

12

15

86

 

0,295

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1516

76168

brain

6

18

1

14

2

20

4

11

12

11

1

2

7

19

128

 

0,271

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693

19572

brain

2

1

0

2

3

8

2

3

5

0

4

4

2

3

39

 

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690

38933

brain

1

4

1

3

2

18

3

9

5

7

1

1

1

13

69

 

0,280

1,212

727

35181

brain

2

4

0

0

2

2

9

4

2

3

1

1

1

6

37

 

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671

45673

breast

0

9

1

21

1

11

10

7

4

121

0

0

5

10

200

 

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673

61040

breast

3

12

1

12

2

24

6

6

2

9

4

2

11

7

101

 

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689

28133

brain

5

3

0

1

2

4

6

5

1

2

0

0

0

1

30

 

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731

17485

ovary

0

1

2

2

2

2

1

1

1

3

0

2

3

6

26

 

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735

42445

ovary

2

5

0

0

4

3

9

4

5

4

3

5

5

2

51

 

0,313

1,544

737

33675

ovary

3

2

0

0

2

0

3

2

3

0

1

2

4

4

26

 

0,328

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736

55002

ovary

13

12

2

7

1

3

10

6

5

5

9

4

14

11

102

 

0,331

1,897

740

65351

prostate

5

14

5

6

9

20

1

7

1

12

1

2

16

14

113

 

0,373

1,540

686

68626

prostate

8

18

2

1

5

18

14

13

3

28

43

10

9

15

187

 

0,420

4,321

12 additional normal libraries

14799

308589

brain

35

44

5

12

8

44

11

9

15

11

9

33

39

55

330

 

0,310

3,377

14796

42498

brain

0

6

0

4

0

3

3

1

2

3

0

1

1

11

35

 

0,249

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14754

33115

breast

5

6

1

1

0

2

3

6

1

0

0

0

4

1

30

 

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14756

58181

breast

1

7

1

1

4

7

7

4

5

11

2

1

3

11

65

 

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1,005

14801

59327

breast

1

7

1

1

4

7

7

4

5

11

2

1

3

11

65

 

0,268

1,005

14757

79152

breast

2

4

6

6

0

8

6

12

2

2

0

0

9

12

69

 

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14798

78288

liver

8

12

9

6

1

17

5

10

7

9

6

3

15

17

125

 

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14749

89265

placenta

2

23

6

8

0

27

5

22

6

14

3

4

21

29

170

 

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1,530

14750

118083

placenta

2

20

6

15

1

26

2

15

9

12

3

4

18

22

155

 

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14780

26653

stomach

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1

8

1

7

14

3

1

5

0

0

5

9

60

 

0,272

1,730

14771

101677

placenta

2

5

4

5

0

12

0

5

5

10

0

1

1

14

64

 

0,331

1,354

7498

31538

brain

6

2

1

4

1

4

4

0

1

1

3

0

2

4

33

 

0,321

1,415

68 additional tumor libraries

14763

106982

brain

8

15

6

7

6

16

7

9

3

13

2

12

16

22

142

 

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1,515

14737

105764

brain

4

10

7

14

10

29

2

8

8

22

3

6

13

20

156

 

0,272

1,458

14765

102439

brain

1

14

1

6

3

14

5

11

6

14

1

6

11

16

109

 

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14739

88568

brain

3

4

5

7

4

17

7

10

4

14

5

1

8

23

112

 

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14773

118733

brain

10

18

10

16

12

28

0

8

6

17

4

6

12

25

172

 

0,182

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14766

107344

brain

5

35

2

9

7

29

0

6

14

31

2

2

21

61

224

 

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1732

81495

brain

0

18

3

0

1

28

5

6

3

7

1

1

6

20

99

 

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1,594

14753

49794

breast

0

3

2

2

1

19

6

6

2

3

2

0

4

5

55

 

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1,476

14748

65314

breast

6

4

2

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2

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