From: Method of predicting Splice Sites based on signal interactions
Nonamer | Probability | Spotted as true signal | Spotted as true-like signal |
---|---|---|---|
CCGGT AAGT | 0.701 | 270 | 115 |
CCGGT GAGT | 0.676 | 755 | 361 |
CGGGT AAGT | 0.668 | 270 | 134 |
ACGGT GAGT | 0.625 | 608 | 364 |
CGGGT GAGT | 0.587 | 586 | 412 |
GCGGT AAGT | 0.575 | 184 | 136 |
TCGGT AAGT | 0.568 | 218 | 166 |
CAGGT AAGC | 0.557 | 1326 | 1055 |
TCGGT GAGT | 0.556 | 503 | 401 |
ACGGT AAGT | 0.551 | 245 | 200 |
GCGGT GAGT | 0.530 | 569 | 504 |
CAGGT GAGT | 0.523 | 2561 | 2335 |
CAGGT AAGT | 0.509 | 1437 | 1388 |
AAGGT GAGT | 0.508 | 2013 | 1952 |
AAGGT AAGC | 0.504 | 1057 | 1039 |
CGCGT AAGT | 0.5 | 36 | 36 |
CCGGT AAGG | 0.489 | 157 | 164 |
CAGGT AAGG | 0.484 | 1667 | 1777 |
CGGGT AAGC | 0.482 | 145 | 156 |
AAGGT AAGT | 0.469 | 1389 | 1569 |
CAGGT AAGA | 0.469 | 1917 | 2172 |
ACGGT AAGG | 0.468 | 162 | 184 |
TCGGT AAGC | 0.457 | 101 | 120 |
CCGGT AAGC | 0.456 | 134 | 160 |
GAGGT AAGT | 0.454 | 978 | 1175 |
ACGGT ACGT | 0.453 | 29 | 35 |
AAGGT ACGT | 0.452 | 193 | 234 |
AAGGT ACGC | 0.423 | 85 | 116 |
GAGGT GAGT | 0.420 | 1717 | 2371 |
AAGGT AAGG | 0.418 | 1318 | 1833 |
AAGGT AAGA | 0.416 | 1610 | 2261 |
ACGGT AAGC | 0.408 | 118 | 171 |
GAGGT AAGC | 0.408 | 634 | 921 |
TCGGT AAGA | 0.408 | 148 | 215 |
CCGGT AAGA | 0.403 | 160 | 237 |
CGGGT AAGG | 0.397 | 219 | 332 |
ACGGT AAGA | 0.397 | 165 | 251 |
AAGGT GAGC | 0.395 | 1325 | 2031 |
CAGGT GAGC | 0.394 | 2073 | 3185 |
CAGGT ACGT | 0.392 | 231 | 358 |